大多数喜好SEO的人都知道通过优化导航工具能够带来更好的阅读体验，但是由于缺乏系统性的优化，导航工具往往带来相反的作用。例如，一些站长们在网站上使用JS导航或浮动的导航工具意欲方便游客浏览网页，结果却影响了搜索引擎的收录。一个替代的方案是采用框架来构建导航工具，由于基于css 模板的混合框架可以非常容易的被搜索引擎收录，这种方法可以在提供用户体验度的同时不影响搜索引擎的收录。

优化网站内部导航包括以下五个方面：
1 导航菜单；
2 HTML 的网页
3 交互式链接
4 嵌入式链接复制
5 站内搜索
在这里站SEO优化的角度提出一个新的网站导航设计的概念，多导航系统运作。尽管在一个站点上只使用一套优秀的导航是大多数人的做法，但使用多个优秀的导航系统并不会带来负面效应。不同于家用计算机上的杀毒软件，多套导航系统并不会导致系统的不稳定，相反地它们可以从不同方面来对网站内容进行导航，以适应更多有不同需要的游客，与此同时它并不会阻碍搜索引擎的收录。

除此以外，Seo技术站认为采用多个导航系统还有以下几种好处：
1)提供更多分类，方便站内文本提供链接；
2)两个导航保持分开，用户可以通过不同的结构浏览文本，引导更多用户阅读结构比较深的内容；
3)使用不同的导航系统引导不同的搜索引擎收录网页。当然，这种方法可有一定的坏处，就是加大了站长的工作时间，在每次更新内容的时候，站长必须对多个导航系统进行调节。由于需要克服这个困难，这里需要进行一些权衡。通常而言，越是大型内容复杂的站点采用多导航系统的受益就越高，而那些小型的站点则不太适合采用过多的导航系统。在采用多个导航系统是否会带来惩罚的问题上，这里可以肯定的说不会。